Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col5a3Q9JLI2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Col5a3Q9JLI2 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Col5a3Q9JLI2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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