Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms