Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms