Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Akap7-202ENSMUST00000095779 919 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms