Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim54Q9ERP3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim54Q9ERP3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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