Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms