Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pop5Q9DB28 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms