Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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Pdzd9Q9D9M4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Pdzd9Q9D9M4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Pdzd9Q9D9M4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Pdzd9Q9D9M4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Pdzd9Q9D9M4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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Pdzd9Q9D9M4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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