Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmco5aQ9D9D5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmco5aQ9D9D5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms