Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Snx5Q9D8U8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Snx5Q9D8U8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Snx5Q9D8U8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Snx5Q9D8U8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Snx5Q9D8U8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Snx5Q9D8U8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Snx5Q9D8U8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Snx5Q9D8U8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Snx5Q9D8U8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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