Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Srp19Q9D7A6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Srp19Q9D7A6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Srp19Q9D7A6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Srp19Q9D7A6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Srp19Q9D7A6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Srp19Q9D7A6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Srp19Q9D7A6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Srp19Q9D7A6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srp19Q9D7A6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Srp19Q9D7A6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Srp19Q9D7A6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Srp19Q9D7A6 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Srp19Q9D7A6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srp19Q9D7A6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms