Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rasgef1cQ9D300 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms