Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syf2Q9D198 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms