Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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Hddc3Q9D114 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms