Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms