Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ndc80Q9D0F1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ndc80Q9D0F1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndc80Q9D0F1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms