Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gtpbp8Q9CY28 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms