Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Snx7Q9CY18 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Snx7Q9CY18 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Snx7Q9CY18 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Snx7Q9CY18 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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