Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nip7Q9CXK8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms