Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Tdrd12Q9CWU0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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