Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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