Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BccipQ9CWI3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms