Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms