Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PsenenQ9CQR7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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