Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms