Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg3Q9CPX6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms