Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Mrpl3Q99N95 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Mrpl3Q99N95 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Mrpl3Q99N95 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Mrpl3Q99N95 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Mrpl3Q99N95 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Mrpl3Q99N95 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Mrpl3Q99N95 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl3Q99N95 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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