Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms