Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms