Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms