Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms