Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trim59Q922Y2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trim59Q922Y2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trim59Q922Y2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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