Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms