Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8VCE4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms