Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnaaf4Q8R368 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms