Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms