Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf183Q8QZS5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms