Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms