Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Prpf39Q8K2Z2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Prpf39Q8K2Z2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Prpf39Q8K2Z2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Prpf39Q8K2Z2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Prpf39Q8K2Z2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Prpf39Q8K2Z2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Prpf39Q8K2Z2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Prpf39Q8K2Z2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Prpf39Q8K2Z2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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