Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf13Q8K2W6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms