Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mtmr3Q8K296 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms