Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Znf628Q8CJ78 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Znf628Q8CJ78 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Znf628Q8CJ78 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Znf628Q8CJ78 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Znf628Q8CJ78 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Znf628Q8CJ78 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Znf628Q8CJ78 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Znf628Q8CJ78 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Znf628Q8CJ78 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Znf628Q8CJ78 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Znf628Q8CJ78 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Znf628Q8CJ78 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Znf628Q8CJ78 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Znf628Q8CJ78 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Znf628Q8CJ78 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf628Q8CJ78 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms