Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbsnQ8CIT9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms