Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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