Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Brf1Q8CFK2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Brf1Q8CFK2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Brf1Q8CFK2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Brf1Q8CFK2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Brf1Q8CFK2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Brf1Q8CFK2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Brf1Q8CFK2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brf1Q8CFK2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms