Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm9955Q8CEJ8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms