Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup88Q8CEC0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms