Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ephb1Q8CBF3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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