Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tsr2Q8C8T8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms