Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek11Q8C0Q4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek11Q8C0Q4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms